جمعیت فراوان و متنوعی از باکتری ها در دستگاه گوارش اکثر حیوانات زندگی می کنند و اکثر این باکتری ها رابطه همزیستی با میزبان خود برقرار می سازند. اهمیت و نقش میکروفلور دستگاه گوارش بر روی وضعیت سلامت و بیماری در حیوانات و انسان به طور قابل توجهی شناخته شده است. میکروارگانیسم هایی که در دستگاه گوارش تجمع می یابند اهمیت بارزی در وضعیت سلامت میزبان دارند. با این وجود ترکیب میکروفلور دستگاه گوارش و فعالیت های متابولیکی آن ها توسط بسیاری از عوامل تحت تاثیر قرار می گیرد که تغذیه مهمترین عامل است. لذا بایستی فورمولاسیون جیره طوری صورت پذیرد که مطلوب ترین اثر را در جمعیت میکروبی دستگاه گوارش داشته باشد. تغذیه با پروبیوتیک ها می تواند به عنوان وسیله ای برای دستیابی به این هدف باشد.
در حال حاضر تحقیقات نشان می دهد که میکروارگانیسم های پروبیوتیکی به همان میزان که در انسان موثر می باشد، در حیوانات نیز تاثیرات بالقوه ای دارند. اکثر باکتری های پروبیوتیکی که در تغذیه حیوانات استفاده می شوند شامل گونه های باکتریایی نظیر انتروکوکوس، پدیوکوکوس، لاکتوباسیلوس، بیفیدوباکتریوم و باسیلوس می باشند. در مطالعات علمی مختلف نشان داده شده است که این باکتری ها در جلوگیری از فعالیت عوامل بیماری زا، تعدیل میکروفلور روده و هماهنگ کردن سیستم ایمنی اثر مطلوبی دارند. تغذیه حیوانات با محصولات پروبیوتیکی می تواند به عنوان یک ابزار در مدیریت مناسب جمعیت میکروبی دستگاه گوارش به منظور ایجاد وضعیت بهتر سلامتی و کارایی موثر حیوان به کار رود.
